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506.#.#.a: Público

590.#.#.d: Los artículos enviados a TIP Revista especializada en ciencias químico-biológicas se juzgan por medio de un proceso de revisión por pares

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561.#.#.u: https://www.zaragoza.unam.mx/

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336.#.#.3: Artículo de Investigación

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041.#.7.h: spa

520.3.#.a: Los acantilados de actividad se definen como compuestos con alta similitud estructural, pero también con alta diferencia en potencia. Estos compuestos tienen un impacto significativo en la optimización de líderes en química medicinal y en aplicaciones computacionales, como el desarrollo de modelos predictivos y en la selección de moléculas de referencia en búsquedas basadas en similitud molecular. Por lo tanto, es de gran relevancia la identificación de compuestos altamente asociados con los acantilados como por ejemplo los “generadores de acantilados de actividad”. En este trabajo se reportan la identificación de acantilados de actividad y las relaciones estructura-actividad de un grupo de 289 compuestos obtenidos por síntesis química que han sido evaluados a través de una proteína quinasa reguladora de receptores acoplados a proteínas-G. Para considerar la información de múltiples representaciones estructurales, se empleó el promedio del índice SALI (Structure-Activity Landscape Index) y se discuten también fragmentos estructurales responsables de la actividad biológica.  Activity cliffs are defined as compounds with high structure similarity but large potency difference. Identification of activity cliffs have a significant impact in lead optimization in medicinal chemistry, and computational applications such as the development of predictive models and the selection of queries for similarity searching. Therefore, the identification of compounds highly associated with activity cliffs in a given data set i.e., ‘activity cliff generators’, is of major relevance. Herein, we report the identification of activity cliffs and structure-activity relationships of a set of 289 synthetic compounds tested in a G protein-coupled receptor kinase, GRK. To account for information of multiple structure representations we used mean Structure-Activity Landscape Index (SALI). Structural fragments responsible for the activity are discussed.

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310.#.#.a: Semestral

300.#.#.a: Páginas: 14-23

264.#.1.b: Facultad de Estudios Superiores Zaragoza, UNAM

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doi: https://doi.org/10.1016/j.recqb.2017.08.002

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245.1.0.b: Uncovering activity cliff generators using distribution of sali values

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No entro en nada

No entro en nada 2

Artículo

Descubriendo los generadores de la actividad de los acantilados, utilizando el índice promedio de los valores de SALI

Martinez Mayorga, Karina; Medina Franco, José L.

Facultad de Estudios Superiores Zaragoza, UNAM, publicado en TIP Revista especializada en Ciencias Químico-Biológicas, y cosechado de Revistas UNAM

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Procedencia del contenido

Cita

Martinez Mayorga, Karina, et al. (2018). Descubriendo los generadores de la actividad de los acantilados, utilizando el índice promedio de los valores de SALI. TIP Revista Especializada en Ciencias Químico-Biológicas; Vol. 21, Núm. 1, 2018; 14-23. Recuperado de https://repositorio.unam.mx/contenidos/4120071

Descripción del recurso

Autor(es)
Martinez Mayorga, Karina; Medina Franco, José L.
Tipo
Artículo de Investigación
Área del conocimiento
Biología y Química
Título
Descubriendo los generadores de la actividad de los acantilados, utilizando el índice promedio de los valores de SALI
Fecha
2017-09-25
Resumen
Los acantilados de actividad se definen como compuestos con alta similitud estructural, pero también con alta diferencia en potencia. Estos compuestos tienen un impacto significativo en la optimización de líderes en química medicinal y en aplicaciones computacionales, como el desarrollo de modelos predictivos y en la selección de moléculas de referencia en búsquedas basadas en similitud molecular. Por lo tanto, es de gran relevancia la identificación de compuestos altamente asociados con los acantilados como por ejemplo los “generadores de acantilados de actividad”. En este trabajo se reportan la identificación de acantilados de actividad y las relaciones estructura-actividad de un grupo de 289 compuestos obtenidos por síntesis química que han sido evaluados a través de una proteína quinasa reguladora de receptores acoplados a proteínas-G. Para considerar la información de múltiples representaciones estructurales, se empleó el promedio del índice SALI (Structure-Activity Landscape Index) y se discuten también fragmentos estructurales responsables de la actividad biológica.  Activity cliffs are defined as compounds with high structure similarity but large potency difference. Identification of activity cliffs have a significant impact in lead optimization in medicinal chemistry, and computational applications such as the development of predictive models and the selection of queries for similarity searching. Therefore, the identification of compounds highly associated with activity cliffs in a given data set i.e., ‘activity cliff generators’, is of major relevance. Herein, we report the identification of activity cliffs and structure-activity relationships of a set of 289 synthetic compounds tested in a G protein-coupled receptor kinase, GRK. To account for information of multiple structure representations we used mean Structure-Activity Landscape Index (SALI). Structural fragments responsible for the activity are discussed.
Tema
Acantilados de actividad; consenso de panoramas de actividad; grk6; índice de panorama estructura-actividad; activity cliff; consensus activity landscape; grk6; structure-activity landscape index
Idioma
spa
ISSN
ISSN electrónico: 2395-8723; ISSN impreso: 1405-888X

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