dor_id: 1500975

506.#.#.a: Público

650.#.4.x: Biología y Química

336.#.#.b: other

336.#.#.3: Registro de colección de proyectos

336.#.#.a: Registro de colección universitaria

351.#.#.b: Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)

351.#.#.a: Colecciones Universitarias Digitales

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270.1.#.p: Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

590.#.#.c: Otro

270.#.#.d: MX

270.1.#.d: México

590.#.#.b: Concentrador

883.#.#.u: https://datosabiertos.unam.mx/

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590.#.#.a: Administración central

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883.#.#.q: Dirección General de Repositorios Universitarios

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100.1.#.a: Santiago Martínez Calvillo

524.#.#.a: Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Estudio de la arquitectura de la cromatina en regiones transcritas por la RNA Polimerasa III y su implicación en la actividad transcripcional en Leishmania", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

720.#.#.a: Santiago Martínez Calvillo

245.1.0.a: Estudio de la arquitectura de la cromatina en regiones transcritas por la RNA Polimerasa III y su implicación en la actividad transcripcional en Leishmania

502.#.#.c: Universidad Nacional Autónoma de México

561.1.#.a: Facultad de Estudios Superiores Iztacala, UNAM

264.#.0.c: 2009

264.#.1.c: 2009

307.#.#.a: 2019-05-23 18:40:21.491

653.#.#.a: Expresión genética en protozoarios parásitos del genero leishmania; Biología molecular y genética

506.1.#.a: La titularidad de los derechos patrimoniales de este recurso digital pertenece a la Universidad Nacional Autónoma de México. Su uso se rige por una licencia Creative Commons BY 4.0 Internacional, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.es, fecha de asignación de la licencia 2009, para un uso diferente consultar al responsable jurídico del repositorio por medio de contacto@dgru.unam.mx

041.#.7.h: spa

500.#.#.a: Síntesis del proyecto Los parásitos protozoarios del género Leishmania pertenecen a la familia Trypanosomatidae, junto con otros parásitos como Trypanosoma. Son varias las especies de Leishmania que infectan al hombre, produciendo enfermedades colectivamente conocidas como leishmaniasis, cuyas manifestaciones clínicas van de asintomáticas a letales. En México, la leishmaniasis cutánea es considerada un problema de salud pública, pues se ha reportado en al menos 22 estados. El genoma de los tripanosomátidos presenta una característica muy particular: los genes se encuentran organizados en grupos grandes de genes localizados en una misma cadena de DNA (unidades policistrónicas). También es inusual el hecho de que estos organismos presentan transcripción policistrónica y trans-splicing, y que aparentemente presentan muy pocas regiones promotoras. Poco se sabe en tripanosomátidos sobre la transcripción de Pol III, la cual sintetiza varios tipos de moléculas de RNA pequeñas que juegan papeles críticos en el metabolismo celular, como RNAs de transferencia (RNAt), RNAr 5S y algunos RNAs pequeños nucleares (snRNA). A la fecha no ha sido caracterizado ningún promotor tipo Pol III en Leishmania. En Trypanosoma brucei han sido parcialmente caracterizados algunos promotores de snRNAs. Estos genes presentan un gen de RNAt en su región flanqueante 5’, en la cadena opuesta. Resulta interesante que las cajas A y B del gen de RNAt contiguo son esenciales para la expresión del snRNA. En Saccharomyces cerevisiae la RNA Pol III consta de diecisiete subunidades. Además de la Pol III, varios factores de transcripción están involucrados en inicio, elongación y término de la transcripción. Éstos incluyen TFIIIA, TFIIIB, TFIIIC, SNAPc y el antígeno La. En Leishmania hemos identificado los genes de la mayoría de las subunidades de Pol III, pero muy pocas subunidades de factores de transcripción han sido localizadas. El número reducido de promotores y la aparente ausencia de muchos de los factores de transcripción en los tripanosomátidos sugieren que la epigenética podría jugar un papel importante en la regulación de la expresión génica en estos organismos. En levadura y eucariontes superiores se sabe que la estructura de la cromatina regula la expresión de los genes. La cromatina existe al menos en formas distintas: una forma condensada relacionada al silenciamiento de la transcripción (heterocromatina) y una forma relajada asociada a la transcripción activa (eucromatina). Diversas modificaciones en las histonas, como la acetilación y la metilación, juegan un papel muy importante en la expresión de un gen. A la fecha se sabe muy poco sobre estructura de la cromatina y regulación epigenética en tripanosomátidos; sin embargo, se presume que este tipo de regulación es importante en estos organismos, dada la presencia en sus genomas de genes de enzimas involucradas en la modificación de histonas, como acetil-transferasas y metil-transferasas. El objetivo principal de este proyecto es el de estudiar diversos aspectos de la transcripción de Pol III en L. major. Nuestro interés está principalmente dirigido hacia el estudio de la estructura de la cromatina en las regiones promotoras de Pol III, así como al análisis in vivo de las interacciones entre probables factores de transcripción e histonas modificadas con dichas regiones promotoras. Los objetivos específicos son: [1] identificar los promotores de los genes de los snRNAs U2 y U4 en L. major. El sitio de inicio de la transcripción de los dos genes será mapeado mediante ensayos de 5’-RACE. Se llevarán a cabo deleciones y mutaciones en los genes, y por medio de ensayos de transfección transitoria y “primer extension” identificaremos las secuencias importantes para la actividad promotora. [2] Analizar si los promotores de Pol III y sus regiones flanqueantes están organizados en nucleosomas. Para ello, cromatina será aislada, digerida con nucleasa micrococal y analizada mediante Southern blots con sondas específicas para cada promotor. [3] Analizar in vivo la presencia de histonas modificadas en los genes transcritos por Pol III; esto por medio de ensayos de inmunoprecipitación de la cromatina (CHIP), empleando anticuerpos contra histonas acetiladas y metiladas. [4] Estudiar in vivo la unión de probables factores de transcripción con los promotores de Pol III; para esto también se realizarían ensayos CHIP con anticuerpos contra BRF1 (subunidad de TFIIIB), SNAP50 (subunidad de SNAPc) y el antígeno La.

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No entro en nada

No entro en nada 2

Registro de colección universitaria

Estudio de la arquitectura de la cromatina en regiones transcritas por la RNA Polimerasa III y su implicación en la actividad transcripcional en Leishmania

Facultad de Estudios Superiores Iztacala, UNAM, Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias

Licencia de uso

Procedencia del contenido

Entidad o dependencia
Facultad de Estudios Superiores Iztacala, UNAM
Entidad o dependencia
Dirección General de Asuntos del Personal Académico
Acervo
Colecciones Universitarias Digitales
Repositorio
Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias
Contacto
Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

Cita

Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Estudio de la arquitectura de la cromatina en regiones transcritas por la RNA Polimerasa III y su implicación en la actividad transcripcional en Leishmania", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

Descripción del recurso

Título
Estudio de la arquitectura de la cromatina en regiones transcritas por la RNA Polimerasa III y su implicación en la actividad transcripcional en Leishmania
Colección
Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)
Responsable
Santiago Martínez Calvillo
Fecha
2009
Descripción
Síntesis del proyecto Los parásitos protozoarios del género Leishmania pertenecen a la familia Trypanosomatidae, junto con otros parásitos como Trypanosoma. Son varias las especies de Leishmania que infectan al hombre, produciendo enfermedades colectivamente conocidas como leishmaniasis, cuyas manifestaciones clínicas van de asintomáticas a letales. En México, la leishmaniasis cutánea es considerada un problema de salud pública, pues se ha reportado en al menos 22 estados. El genoma de los tripanosomátidos presenta una característica muy particular: los genes se encuentran organizados en grupos grandes de genes localizados en una misma cadena de DNA (unidades policistrónicas). También es inusual el hecho de que estos organismos presentan transcripción policistrónica y trans-splicing, y que aparentemente presentan muy pocas regiones promotoras. Poco se sabe en tripanosomátidos sobre la transcripción de Pol III, la cual sintetiza varios tipos de moléculas de RNA pequeñas que juegan papeles críticos en el metabolismo celular, como RNAs de transferencia (RNAt), RNAr 5S y algunos RNAs pequeños nucleares (snRNA). A la fecha no ha sido caracterizado ningún promotor tipo Pol III en Leishmania. En Trypanosoma brucei han sido parcialmente caracterizados algunos promotores de snRNAs. Estos genes presentan un gen de RNAt en su región flanqueante 5’, en la cadena opuesta. Resulta interesante que las cajas A y B del gen de RNAt contiguo son esenciales para la expresión del snRNA. En Saccharomyces cerevisiae la RNA Pol III consta de diecisiete subunidades. Además de la Pol III, varios factores de transcripción están involucrados en inicio, elongación y término de la transcripción. Éstos incluyen TFIIIA, TFIIIB, TFIIIC, SNAPc y el antígeno La. En Leishmania hemos identificado los genes de la mayoría de las subunidades de Pol III, pero muy pocas subunidades de factores de transcripción han sido localizadas. El número reducido de promotores y la aparente ausencia de muchos de los factores de transcripción en los tripanosomátidos sugieren que la epigenética podría jugar un papel importante en la regulación de la expresión génica en estos organismos. En levadura y eucariontes superiores se sabe que la estructura de la cromatina regula la expresión de los genes. La cromatina existe al menos en formas distintas: una forma condensada relacionada al silenciamiento de la transcripción (heterocromatina) y una forma relajada asociada a la transcripción activa (eucromatina). Diversas modificaciones en las histonas, como la acetilación y la metilación, juegan un papel muy importante en la expresión de un gen. A la fecha se sabe muy poco sobre estructura de la cromatina y regulación epigenética en tripanosomátidos; sin embargo, se presume que este tipo de regulación es importante en estos organismos, dada la presencia en sus genomas de genes de enzimas involucradas en la modificación de histonas, como acetil-transferasas y metil-transferasas. El objetivo principal de este proyecto es el de estudiar diversos aspectos de la transcripción de Pol III en L. major. Nuestro interés está principalmente dirigido hacia el estudio de la estructura de la cromatina en las regiones promotoras de Pol III, así como al análisis in vivo de las interacciones entre probables factores de transcripción e histonas modificadas con dichas regiones promotoras. Los objetivos específicos son: [1] identificar los promotores de los genes de los snRNAs U2 y U4 en L. major. El sitio de inicio de la transcripción de los dos genes será mapeado mediante ensayos de 5’-RACE. Se llevarán a cabo deleciones y mutaciones en los genes, y por medio de ensayos de transfección transitoria y “primer extension” identificaremos las secuencias importantes para la actividad promotora. [2] Analizar si los promotores de Pol III y sus regiones flanqueantes están organizados en nucleosomas. Para ello, cromatina será aislada, digerida con nucleasa micrococal y analizada mediante Southern blots con sondas específicas para cada promotor. [3] Analizar in vivo la presencia de histonas modificadas en los genes transcritos por Pol III; esto por medio de ensayos de inmunoprecipitación de la cromatina (CHIP), empleando anticuerpos contra histonas acetiladas y metiladas. [4] Estudiar in vivo la unión de probables factores de transcripción con los promotores de Pol III; para esto también se realizarían ensayos CHIP con anticuerpos contra BRF1 (subunidad de TFIIIB), SNAP50 (subunidad de SNAPc) y el antígeno La.
Tema
Expresión genética en protozoarios parásitos del genero leishmania; Biología molecular y genética
Identificador global
http://datosabiertos.unam.mx/DGAPA:PAPIIT:IN203909

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