dor_id: 1501559

506.#.#.a: Público

650.#.4.x: Biología y Química

336.#.#.b: other

336.#.#.3: Registro de colección de proyectos

336.#.#.a: Registro de colección universitaria

351.#.#.b: Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)

351.#.#.a: Colecciones Universitarias Digitales

harvesting_group: ColeccionesUniversitarias

270.1.#.p: Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

590.#.#.c: Otro

270.#.#.d: MX

270.1.#.d: México

590.#.#.b: Concentrador

883.#.#.u: https://datosabiertos.unam.mx/

883.#.#.a: Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias

590.#.#.a: Administración central

883.#.#.1: http://www.ccud.unam.mx/

883.#.#.q: Dirección General de Repositorios Universitarios

850.#.#.a: Universidad Nacional Autónoma de México

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100.1.#.a: David Sebastián Gernandt

524.#.#.a: Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Integración de datos morfológicos y moleculares para el género Pinus (Pinaceae)", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

720.#.#.a: David Sebastián Gernandt

245.1.0.a: Integración de datos morfológicos y moleculares para el género Pinus (Pinaceae)

502.#.#.c: Universidad Nacional Autónoma de México

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264.#.0.c: 2009

264.#.1.c: 2009

307.#.#.a: 2019-05-23 18:40:21.491

653.#.#.a: Sistemática y evolución; Botánica

506.1.#.a: La titularidad de los derechos patrimoniales de este recurso digital pertenece a la Universidad Nacional Autónoma de México. Su uso se rige por una licencia Creative Commons BY 4.0 Internacional, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.es, fecha de asignación de la licencia 2009, para un uso diferente consultar al responsable jurídico del repositorio por medio de contacto@dgru.unam.mx

041.#.7.h: spa

500.#.#.a: Mientras la diversidad de otras gimnospermas sufrió un declive después de la aparición de las angiospermas, el género Pinus (Pinaceae) sufrió una diversificación excepcional en la región que actualmente forma parte de México. Se estima que México cuenta con ~51 de las 118 especies de Pinus, las cuáles representan 43% de la diversidad mundial del género y 4.8% de las gimnospermas. Los pinos forman bosques y bosquecillos en una gran diversidad de ambientes. Mientras que el género ha sido sujeto de numerosos estudios taxonómicos y filogenéticos, el conocimiento sobre las relaciones y delimitaciones de especies, su distribución y su origen, es aún incompleto. Una gran interrogante actual es que aunque filogenias moleculares con base en DNA del cloroplasto y el núcleo resuelven los mismos grupos principales (dos subgéneros, cuatro secciones y once subsecciones) y se encuentra una cierta congruencia con clasificaciones tradicionales, se desconocen las novedades evolutivas morfológicas o anatómicas que marcan cada linaje. Este problema dificulta nuestra habilidad de interpretar el registro fósil, la cual depende de caracteres morfológicos y anatómicos. Esto a su vez dificulta la habilidad de asignar fósiles del Cretácico y Terciario de Pinus y del género órgano para conos, Pityostrobus, a categorías infraespecíficas; así como asignar edades mínimas a clados vivientes y/o para calibrar relojes moleculares. Como consecuencia, los estimados de la edad de la diversificación de pinos en México difieren por un orden de magnitud. En este estudio se integrarán datos moleculares y morfológicos del género para investigar cómo y cuándo llegaron los linajes de pinos a México y cuándo se diversificaron ahí. Los datos que se pretende generar son 1) una matriz de cpDNA que comprende 5.4 kpb para 118 especies, 2) una matriz morfológica actualizada de ~100 caracteres, de los cuáles ~70% proviene de conos ovulados, para los géneros de Pinaceae y 11 representantes vivientes de Pinus más 10 fósiles, 3) una matriz de cpDNA complementaria de 5.8 kpb para un total de 148 individuos para las ~51 especies de la sección Trifoliae y 4) dos matrices de genes nucleares (LEA-like y WD-40) para 148 individuos de la sección Trifoliae. Las preguntas que planteamos son 1) Cuáles son las relaciones entre los haplotipos de cloroplasto para las 118 especies de Pinus? 2) Cómo se relacionan 10 fósiles con las subsecciones actuales? 3) ¿Cuáles son las edades mínimas para la diversificación del género? y 4) ¿Cuales son las relaciones de cloroplasto para la subsección Australes y cómo ayudan junto con dos genes del núcleo en la delimitación de especies? Las matrices de cloroplasto y morfología serán analizadas bajo parsimonia y con inferencia Bayesiana por separado y combinado (evidencia total) y se estimarán edades de linajes y tasas de sustitución mediante un reloj relajado con verosimilitud penalizada. Debido a que los genes nucleares y el cloroplasto tienen historias diferentes entre sí y con respecto a las especies, estos datos se analizarán por separado para inferir filogenias; poner a prueba la monofilia de alelos por especie y calcular el tiempo de coalescencia mediante parámetros de tiempo generacional, tamaño efectivo de poblaciones y diversidad alélica; y la tasa de mutaciones silenciosas. El responsable es un participante (no recibe recursos) del proyecto del National Science Foundation, E.U.A., “Assembling the Tree of Life: Gymnosperms” y se ha diseñado la propuesta actual para que ésta sea complementaria. Adentro de la UNAM, este proyecto fortalecerá la colaboración entre el responsable y otros investigadores del Instituto de Biología (Dr. Mark Olson; generación e interpretación de datos anatómicos de Pinus y Dra. Susana Magallón; para fechado y diversificación de plantas mexicanas), un técnico académico (Biol. Calixto León Gómez; datos anatómicos), se formará un gran parte de la tesis de maestría de al menos un alumno del Posgrado en Ciencias Biológicas (Biól. Sergio Hernández León, con su tesis sobre relaciones filogenéticas de Pinus sección Trifoliae) y enriquecer interacciones con un grupo de trabajo en el Instituto de Ecología (Dr. Daniel Piñero; genética de poblaciones y filogeografía de las coníferas mexicanas).

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No entro en nada

No entro en nada 2

Registro de colección universitaria

Integración de datos morfológicos y moleculares para el género Pinus (Pinaceae)

Instituto de Biología, UNAM, Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias

Licencia de uso

Procedencia del contenido

Entidad o dependencia
Instituto de Biología, UNAM
Entidad o dependencia
Dirección General de Asuntos del Personal Académico
Acervo
Colecciones Universitarias Digitales
Repositorio
Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias
Contacto
Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

Cita

Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Integración de datos morfológicos y moleculares para el género Pinus (Pinaceae)", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

Descripción del recurso

Título
Integración de datos morfológicos y moleculares para el género Pinus (Pinaceae)
Colección
Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)
Responsable
David Sebastián Gernandt
Fecha
2009
Descripción
Mientras la diversidad de otras gimnospermas sufrió un declive después de la aparición de las angiospermas, el género Pinus (Pinaceae) sufrió una diversificación excepcional en la región que actualmente forma parte de México. Se estima que México cuenta con ~51 de las 118 especies de Pinus, las cuáles representan 43% de la diversidad mundial del género y 4.8% de las gimnospermas. Los pinos forman bosques y bosquecillos en una gran diversidad de ambientes. Mientras que el género ha sido sujeto de numerosos estudios taxonómicos y filogenéticos, el conocimiento sobre las relaciones y delimitaciones de especies, su distribución y su origen, es aún incompleto. Una gran interrogante actual es que aunque filogenias moleculares con base en DNA del cloroplasto y el núcleo resuelven los mismos grupos principales (dos subgéneros, cuatro secciones y once subsecciones) y se encuentra una cierta congruencia con clasificaciones tradicionales, se desconocen las novedades evolutivas morfológicas o anatómicas que marcan cada linaje. Este problema dificulta nuestra habilidad de interpretar el registro fósil, la cual depende de caracteres morfológicos y anatómicos. Esto a su vez dificulta la habilidad de asignar fósiles del Cretácico y Terciario de Pinus y del género órgano para conos, Pityostrobus, a categorías infraespecíficas; así como asignar edades mínimas a clados vivientes y/o para calibrar relojes moleculares. Como consecuencia, los estimados de la edad de la diversificación de pinos en México difieren por un orden de magnitud. En este estudio se integrarán datos moleculares y morfológicos del género para investigar cómo y cuándo llegaron los linajes de pinos a México y cuándo se diversificaron ahí. Los datos que se pretende generar son 1) una matriz de cpDNA que comprende 5.4 kpb para 118 especies, 2) una matriz morfológica actualizada de ~100 caracteres, de los cuáles ~70% proviene de conos ovulados, para los géneros de Pinaceae y 11 representantes vivientes de Pinus más 10 fósiles, 3) una matriz de cpDNA complementaria de 5.8 kpb para un total de 148 individuos para las ~51 especies de la sección Trifoliae y 4) dos matrices de genes nucleares (LEA-like y WD-40) para 148 individuos de la sección Trifoliae. Las preguntas que planteamos son 1) Cuáles son las relaciones entre los haplotipos de cloroplasto para las 118 especies de Pinus? 2) Cómo se relacionan 10 fósiles con las subsecciones actuales? 3) ¿Cuáles son las edades mínimas para la diversificación del género? y 4) ¿Cuales son las relaciones de cloroplasto para la subsección Australes y cómo ayudan junto con dos genes del núcleo en la delimitación de especies? Las matrices de cloroplasto y morfología serán analizadas bajo parsimonia y con inferencia Bayesiana por separado y combinado (evidencia total) y se estimarán edades de linajes y tasas de sustitución mediante un reloj relajado con verosimilitud penalizada. Debido a que los genes nucleares y el cloroplasto tienen historias diferentes entre sí y con respecto a las especies, estos datos se analizarán por separado para inferir filogenias; poner a prueba la monofilia de alelos por especie y calcular el tiempo de coalescencia mediante parámetros de tiempo generacional, tamaño efectivo de poblaciones y diversidad alélica; y la tasa de mutaciones silenciosas. El responsable es un participante (no recibe recursos) del proyecto del National Science Foundation, E.U.A., “Assembling the Tree of Life: Gymnosperms” y se ha diseñado la propuesta actual para que ésta sea complementaria. Adentro de la UNAM, este proyecto fortalecerá la colaboración entre el responsable y otros investigadores del Instituto de Biología (Dr. Mark Olson; generación e interpretación de datos anatómicos de Pinus y Dra. Susana Magallón; para fechado y diversificación de plantas mexicanas), un técnico académico (Biol. Calixto León Gómez; datos anatómicos), se formará un gran parte de la tesis de maestría de al menos un alumno del Posgrado en Ciencias Biológicas (Biól. Sergio Hernández León, con su tesis sobre relaciones filogenéticas de Pinus sección Trifoliae) y enriquecer interacciones con un grupo de trabajo en el Instituto de Ecología (Dr. Daniel Piñero; genética de poblaciones y filogeografía de las coníferas mexicanas).
Tema
Sistemática y evolución; Botánica
Identificador global
http://datosabiertos.unam.mx/DGAPA:PAPIIT:IN228209

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